福州大学管理科学与工程学科始建于 1981 年，其学科基础可追溯于 1981 年创立的工业管理工程系。1994 年获得硕士学位授予权，2004年在机械设计及理论二级学科博士点下开始招收工业工程博士研究生，2005 年被确定为福建省重点学科，2006 年获得管理科学与工程一级学科博士学位授予权，2007 年获得管理系统工程、信息管理与信息系统、金融工程、科技与教育管理、物流管理、电子政务与区域资源管理等 6 个二级学科博士学位授予权，2008 年被列为“国家 211 工程”三期重点学科建设项目，2012 年获批设立博士后科研流动站，同年被评为福建省特色重点学科。在 2012 年全国 102 所参评高校学科评估中，与南开大学、吉林大学等 13 所高校并列第 34 位。在 2016 年度和 2021年度教育部第四轮和第五轮学科评估中，福州大学管理科学与工程学科均位列 b 档，在福建省高校中排名第一。在 2022 年软科中国最好学科排名中位列第 32 名（前 13%）。
本学位点依托管理科学与工程省级特色重点学科、管理科学与工程省级重点学科和“管理科学理论、方法及其应用”国家“211 工程”重点学科建设项目，以建设世界一流学科为目标，瞄准学科发展前沿，围绕国家和福建省政治、经济、科教发展战略目标以及管理科学与工程研究发展的需求，本着“加强应用、重视基础、突出特色”的思路，设置了 7 个二级博士专业培养方向和 4 个二级硕士专业培养方向，研究解决社会、经济、科教和工程等方面急需解决的管理问题，以达到服务国家区域经济发展和培养高素质复合型人才的目的。